Siempre que aparece un nuevo título de la serie Zelda los aficionados a la saga estan muy pendientes de un aspecto del juego a que se le suele prestar bastante atención, la música.
Desde las primeras entregas en NES los usuarios han identificado a Zelda con melodias épicas y pegadizas. Casi todas las entregas suelen cumplir con este precepto, y apesar de que suelen abundar las remezclas siempre hay sitios para hermosas melodias. En esta ocasión podemos escuchar la melodia principal del juego: el tema del mapa mundi.
Como suele ser habitual, en este Zelda Spirits Tracks, Koji Kondo vuelve a colaborar con la banda sonora, eso si ya no con la importancia de hace unos años.